در زیرزمین موزه بخش اداری و مخزن موزه قرار دارد، که در این قسمت علاوه بر نگهداری تمامی اسناد و مدارک تاریخی مجموعه، به پژوهشگران و علاقمندان نیز خدمات مناسب جهت انجام فعالیت های پژوهشی ارائه می شود.